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海南省海洋与渔业科学院内设综合处、科研管理和信息处2个副处级行政机构；海洋工程研究所、海洋生态研究所、海水渔业研究所、淡水渔业研究所、水产病害与防治研究所、环境综合实验中心、海洋经济规划与信息研究所7个科研机构。现有国家及省属公益性机构包括：国家级南美白对虾遗传育种中心、国家特色淡水鱼产业技术体系海口综合试验站、国家虾蟹产业体系琼海综合实验站、国家海水鱼产业技术体系陵水站、国家藻类体系海口综合试验站、海南省水生动物疫病监控中心、国家级良种场、省级热带海水养殖工程技术研究中心、省级海洋捕捞工程技术研究中心、热带典型生态系统（海草-珊瑚）研究中心、省一级海洋渔业船员培训机构、水产科技“110”服务站、农业部渔业行业职业技能鉴定指导站海南省水产研究工作站等。
海南省海洋与渔业科学院内设综合处、科研管理和信息处2个副处级行政机构；海洋工程研究所、海洋生态研究所、海水渔业研究所、淡水渔业研究所、水产病害与防治研究所、环境综合实验中心、海洋经济规划与信息研究所7个科研机构。现有国家及省属公益性机构包括：国家级南美白对虾遗传育种中心、国家特色淡水鱼产业技术体系海口综合试验站、国家虾蟹产业体系琼海综合实验站、国家海水鱼产业技术体系陵水站、国家藻类体系海口综合试验站、海南省水生动物疫病监控中心、国家级良种场、省级热带海水养殖工程技术研究中心、省级海洋捕捞工程技术研究中心、热带典型生态系统（海草-珊瑚）研究中心、省一级海洋渔业船员培训机构、水产科技“110”服务站、农业部渔业行业职业技能鉴定指导站海南省水产研究工作站等。
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